As auditorias Friend of the Sea devem ser realizadas por organismos de certificação acreditados por organismos de acreditação nacionais.
Organismos de Acreditação Nacionais fazem a auditoria e acreditação de organismos de certificação que pediram a extensão do seu âmbito de acreditação para o padrão Friend of the Sea.
A Rina, a DNV GL, Control Union, London Associati e a SGS são os organismos de certificação atualmente credenciados pelos Organismos de Acreditação Nacionais para realizar auditorias de alimentos do mar de certificação Friend of the Sea.
