عندما يتدهور موئل طبيعي أو يتعرض للتدمير، تتسع سلسلة الآثار السلبية وتتعمق. ففقدان التنوع البيولوجي يقلل قدرة النظم البيئية على الصمود، ويجعل الأنظمة الطبيعية أكثر عرضة للظواهر المناخية المتطرفة مثل الجفاف والفيضانات وموجات الحر.

فعلى سبيل المثال، يؤدي تدمير مروج الأعشاب البحرية أو الشعاب المرجانية أو مناطق التكاثر في البيئات البحرية إلى اضطراب دورات الحياة بأكملها، مع آثار مدمرة على أنواع كثيرة من الأسماك. وعلى اليابسة، يؤدي اختفاء الموائل الأساسية إلى تسريع خطر انقراض أنواع عديدة، وكثير منها مستوطن.

وفضلاً عن ذلك، فإن فقدان النظم البيئية الطبيعية يحرم البشرية من خدمات أساسية، بدءاً من امتصاص الكربون وتنظيم المناخ، وصولاً إلى تنقية المياه وإنتاج الأكسجين.